En Septembre 2018, Alain Godonou, collaborateur de l'ICCROM de longue date, a été nommé Directeur du Programme Musées de l’Agence Nationale de promotion des Patrimoines et du Tourisme au Bénin (ANPT), rattachée à la Présidence de la République. Alain est un ancien élève du programme PREMA de l’ICCROM (Prévention dans les Musées Africains). En 2000 il a fondé l’École du Patrimoine Africain (EPA) à Porto Novo au Bénin, qu’il a dirigé jusqu’à sa nomination en 2010 comme Directeur des programmes culturels à l’UNESCO, puis comme représentant des Bureaux multipays au Gabon (Afrique Centrale), puis à Samoa (Pacifique).
L’ANPT pilote les grands chantiers nationaux dont le Musée International de la Mémoire et de l'Esclavage ( MIME) dans l'ancien Fort portugais de Ouidah, et le Musée de l'épopée des Rois et des Amazones d'Abomey pour soutenir la mise en valeur du site des Palais royaux d'Abomey classé au Patrimoine mondial.
Sur décret présidentiel, Alain Godonou est aussi Vice-Président du "Comité de coopération muséale et patrimoniale entre le Bénin et la France". Le rôle de ce comité est d'étudier les conditions pour le retour de biens culturels dont le pays a été dépossédé.